Jason BOURNE (Matt Damon) se před dvěma lety domníval, že své minulosti utekl. Nyní ho minulost opět dohání. BOURNE a Marie (Franka Potente) dál žijí v anonymitě. BOURNEA ženou noční můry a vzpomínky. Vláčí Marii z města do města. Snaží se být vždy krok před hrozbou, kterou tuší v každém pohledu i v každém telefonním "omylu", před nebezpečím, které očekává v každé vteřině. Ale ohrožení jej do světa, z něhož chtěl uniknout, neustále vrací. Když se v poklidné vsi, která je jejich dočasným domovem, objeví tajný agent, BOURNE s Marií místo kvapně opuštějí ...