Příběh se točí kolem sporů a bojů mezi rodem Albů a jejich loajálních příznivců na jedné straně; a rodem Mendozů s Antoniem Perezem a princeznou Eboli na straně druhé. V noci o velikonočním pondělí roku 1578 několik zabijáků nečekaně napadne a zavraždí Juana de Escobeda. “Konspirace v El Escorial” je historický film natočený podle skutečných událostí, kdy se nedílnou součástí života na královském dvoře Filipa II. stává soupeření o moc a smrt.